쓰리빌리언

• 주력 수익 모델은 의료기관으로부터 유전자 검사를 의뢰받아 분석 결과를 제공하는 서비스로, 전장 엑솜 및 유전체 시퀀싱(WES/WGS) 기반의 진단 검사 수요가 글로벌하게 증가하면서 최근 3년 연속 매출이 2배 이상 성장하는 성과를 거두었다.

• 2025년에 출시한 인공지능 유전변이 해석 소프트웨어 '제브라(GEBRA)'를 통해 서비스형 소프트웨어(SaaS) 시장에 진출하여 매출 다각화를 꾀하고 있다. 이 플랫폼은 전 세계 20개국 이상의 의료진과 연구진이 도입하여 활용 중이며, 병원이나 연구소에서 자체적으로 대규모 유전체 데이터를 분석하고 진단 효율을 높일 수 있도록 돕는다.

• 축적된 방대한 희귀질환 환자 데이터를 기반으로 신약 개발 사업에도 뛰어들었다. 자체 개발한 신약 후보물질 발굴 플랫폼 '3B-TARGET'을 통해 진단에서 치료로 사업 영역을 확장하며 새로운 성장 동력을 확보하고 글로벌 제약사와의 공동 개발 및 기술수출을 목표로 하고 있다.

• AI 유전체 진단 산업은 인간의 유전 정보를 분석하여 질병을 진단, 예측, 치료하는 정밀의료의 핵심 분야로, 특히 원인 규명이 어려운 희귀질환 영역에서 그 중요성이 더욱 커지고 있다. 기존 선별적 검사 방식에서 전장유전체(WGS)나 전장엑솜(WES)을 한 번에 분석하는 방식으로 패러다임이 변화하면서 AI의 역할이 절대적으로 중요해졌다.

• 한 명의 유전체 데이터에서 수백만 개의 변이가 발견되는데, 이 중 질병의 원인이 되는 변이를 찾아내는 것은 인간의 능력만으로는 한계가 있다. 쓰리빌리언과 같은 기업들은 자체 개발한 AI 알고리즘을 통해 이 과정을 자동화하고, 단 몇 분 만에 99% 이상의 정확도로 질병 원인 유전변이를 찾아내며 진단의 효율성과 정확성을 획기적으로 높이고 있다.

• 글로벌 시장은 연간 10% 이상의 높은 성장률을 보일 것으로 예상되며, 특히 미국 시장이 가장 큰 비중을 차지하고 있다. 쓰리빌리언 역시 2026년 미국 텍사스에 현지 실험실을 설립하고 본격적으로 북미 시장 공략에 나서며 글로벌 경쟁사와의 정면 승부를 예고하고 있다.

미국은 전 세계에서 가장 큰 희귀질환 진단 시장으로, 쓰리빌리언의 미래 성장을 결정할 핵심 전초기지라 할 수 있다. 단순히 인구가 많아서가 아니라, 유전체 분석 검사에 대한 보험 수가 적용이 활발하고 검사 단가 자체도 높아 매력적인 시장이기 때문이다. 회사는 2022년 12월 미국 실험실 표준 인증(CLIA)을 획득하며 일찌감치 미국 시장 진출의 교두보를 마련했으며, 2026년 2분기부터 텍사스 오스틴에 설립한 현지 법인에서 본격적인 매출 발생을 기대하고 있다. 이는 타 지역 대비 5~6배 높은 단가를 받는 미국 보험 시장에 본격적으로 안착하겠다는 신호탄으로, 회사의 퀀텀 점프를 이끌 기폭제가 될 전망이다.

진단 사업을 통해 전 세계 80여 개국에서 차곡차곡 쌓아 올린 8만 건 이상의 희귀질환 환자 유전체 및 임상 데이터는 쓰리빌리언의 가장 강력한 무기다. 이 데이터는 단순히 양만 많은 것이 아니라, 다인종, 다기관, 다국가에서 수집된 양질의 데이터라는 점에서 그 가치가 더욱 빛난다. AI 모델의 성능은 결국 데이터의 질과 양에 따라 결정되는데, 쓰리빌리언은 이 데이터를 활용해 AI 변이 해석 모델의 정확도를 경쟁사 대비 높은 수준으로 끌어올렸다. 나아가 이 독보적인 데이터 경쟁력은 희귀질환 치료제 개발이라는 새로운 영역으로 나아가는 든든한 발판이 되고 있으며, 새로운 신약 타겟을 발굴하는 데 핵심적인 역할을 하고 있다.

• [기대] 2025년 연간 매출이 전년 대비 두 배 이상 성장하며 117억 원을 달성했고, 영업손실 또한 59억 원으로 전년 대비 20%가량 감소하는 등 외형 성장과 수익성 개선이 동시에 이루어지고 있다는 점에 기대를 걸고 있다. 특히 7분기 연속 매출 성장세를 보이는 등 성장 가시성이 매우 높다는 평가다.

• [기대] 세계 최대 희귀질환 진단 시장인 미국에 2025년 10월 텍사스 법인을 설립하며 본격적인 공략을 시작했으며, 2026년부터 현지 매출 발생이 예상된다. 미국은 유전자 검사 단가가 타 지역 대비 5~6배 높아, 미국 시장 안착 시 폭발적인 실적 성장이 기대되는 상황이다.

• [우려] 지속적인 연구개발(R&D) 투자와 미국 법인 설립 등 해외 시장 확장을 위한 선행 투자가 계속되고 있어, 흑자 전환 시점이 지연될 수 있다는 점은 잠재적인 우려 요인으로 꼽힌다. 다만, 매출 성장세에 힘입어 매출액 대비 영업손실 비율은 꾸준히 개선되고 있다.

2025년 4분기

• 분기 기준 역대 최대인 39억 원의 매출을 기록하며, 회사의 폭발적인 성장세를 다시 한번 증명했다.

• 연간 매출 117억 원, 영업손실 59억 원을 최종 확정 짓는 분기로, 2023년부터 3년 연속 연 매출 2배 이상 성장을 달성하는 데 쐐기를 박았다.

• AI 유전변이 해석 소프트웨어 '제브라(GEBRA)'의 SaaS 모델이 글로벌 시장에 안착하기 시작하며, 기존의 진단 서비스 외에 새로운 수익원으로 자리 잡을 가능성을 보여주었다.

2025년 3분기

• 매출액은 전년 동기 대비 103% 증가한 32억 원을 기록하며 7분기 연속 성장이라는 기염을 토했다. 직전 분기와 비교해도 25% 증가한 수치로 성장 모멘텀이 더욱 강해지는 모습을 보였다.

• 영업손실은 13억 원으로, 전년 동기 대비 약 25% 개선되었다. 매출이 늘어나는 동시에 비용 효율화가 이루어지면서 손익 구조가 안정화되고 있다는 긍정적 신호를 보냈다.

• 국내 대형 병원 및 글로벌 제약사와의 협력이 확대된 것이 실적에 주효했다. 삼성서울병원 신생아중환자실(NICU) 대상 신속 전장유전체 검사 계약, 바이오젠과의 협력 등이 대표적이다.

2025년 2분기

• 2분기 매출은 26억 원으로 전년 같은 기간보다 101% 증가했으며, 1분기보다도 29.3% 성장하며 가파른 성장세를 유지했다.

• 영업손실은 16억 원을 기록하여 직전 분기의 20억 원 대비 18.9% 감소시키는 데 성공했다. 이는 외형 성장뿐 아니라 내실 다지기에도 성공하고 있음을 시사한다.

• 해외 매출 비중이 72%에 달하며 글로벌 시장에서의 확산세가 두드러졌다. 특히 북중미, 유럽 등 70여 개국에서 신규 의료진 고객이 꾸준히 유입되며 성장을 견인했다.

2025년 1분기

• 2025년의 시작을 알린 1분기 매출은 20억 원으로, 전년 동기 대비 116% 증가하며 '더블 성장' 기조를 이어갔다. 이는 2024년 전체 매출의 35%에 해당하는 금액이다.

• 영업손실은 약 20억 원으로 전년과 비슷한 수준을 유지했다. 이는 연구개발 투자, 인력 확대 등 미래 성장을 위한 투자가 지속되었기 때문으로, 손실 폭이 확대되지 않았다는 점에서 비용 구조가 안정화되고 있는 것으로 평가된다.

• 해외 매출 비중이 2024년 68%에서 2025년 1분기 75%로 더욱 확대되며 글로벌 수요가 실적을 이끌고 있음을 명확히 보여주었다.

최근 주주 구성

• 금창원(17.02%): 쓰리빌리언의 창업자이자 대표이사. 국내 최대 유전체 분석 회사인 마크로젠에서 스핀오프해 회사를 설립했으며, 특수관계인을 포함하면 지분율은 25.09%에 달한다.

• Macrogen, Inc.(7.08%): 국내 대표적인 유전체 분석 기업으로, 쓰리빌리언의 초기 성장 과정에서부터 관계를 맺어온 주요 주주다.

• Morgan Stanley(4.75%): 글로벌 투자은행으로, 쓰리빌리언의 성장 잠재력을 보고 투자한 주요 기관 투자자 중 하나다.

• MAGNA Investment Co., Ltd.(4.56%): 국내 주요 벤처캐피탈로, 다수의 펀드를 통해 쓰리빌리언의 지분을 보유하고 있다.

• Kiwoom-Yuanta 2019 Scale-up Fund(4.27%): 키움인베스트먼트와 유안타인베스트먼트가 공동으로 운용하는 펀드로, 회사의 스케일업 단계에 투자했다.

• 자사주: 현재 공시된 자료상 자사주 보유 내역은 확인되지 않는다.

지분 변동 히스토리

• 2024년 11월 14일 코스닥 시장에 상장하며 주주 구성에 변화가 생겼다. 당시 공모 후 최대주주 및 특수관계인 지분은 24.5% 수준이었다.

• 2025년 11월, 서고훈 비등기임원이 우리사주 인출을 통해 보유 주식 수가 18만 주에서 18만 8894주로 증가(지분율 0.57% -> 0.6%)하는 변동이 있었다.

3billion US, Inc.

• 2025년 10월, 글로벌 최대 시장인 미국을 공략하기 위해 텍사스주 오스틴에 설립한 현지 법인이다.

• 미국 내 보험 청구를 위해 필수적인 CLIA 인증 실험실을 현지에 직접 구축하고, 병원을 대상으로 한 영업 활동까지 수행할 계획을 가지고 있다.

• 2026년 2분기부터 본격적인 매출 발생이 예상되며, 연간 약 5만 건의 검사 처리 능력을 갖추고 쓰리빌리언의 퀀텀 점프를 이끌 핵심 기지로 기대를 모으고 있다.

• (경쟁 관계) 진디엑스(GeneDx): 미국 희귀질환 진단 시장의 강자로, 쓰리빌리언의 주요 경쟁사로 꼽힌다. 하지만 쓰리빌리언은 자체 AI 모델의 진단 정확도가 99.5%에 달하는 반면, 진디엑스의 모델은 69% 수준으로 기술적 우위에 있다고 자신하고 있다.

• (협력 관계) 글로벌 제약사: 아스트라제네카, 노바티스, 바이오젠 등 다수의 글로벌 제약사와 특정 희귀질환 환자를 조기에 발굴하기 위한 공동 진단 프로젝트를 활발히 진행하고 있다. 이는 단순한 진단 서비스를 넘어 신약 개발 생태계로 사업을 확장하려는 전략의 일환이다.

• (협력 관계) 소마젠(Somagen): 유전체 분석 서비스 기업인 소마젠과 미국 시장 진출을 위해 협력하고 있다. 소마젠이 미국 의료기관 등에서 검체를 의뢰받으면 쓰리빌리언이 AI 시스템을 활용해 진단 보고서를 발행하는 구조다.

• (협력 관계) 제네틱얼라이언스(Genetic Alliance): 2026년 3월, 글로벌 희귀질환 환자 단체인 제네틱얼라이언스가 운영하는 'iHope' 프로그램의 아시아 첫 공식 진단 파트너로 선정되었다. 이를 통해 정밀의료의 사각지대에 있는 전 세계 환자들에게 진단 서비스를 제공하며 글로벌 인지도를 높이고 있다.

• 2026.03.05: 글로벌 희귀질환 환자 지원 프로그램 'iHope'의 아시아 지역 공식 진단 파트너로 선정.

• 2026.02.11: 2025년 연간 실적 발표. 매출액 117억 원(전년비 103%↑), 영업손실 59억 원(전년비 20%↓)으로 역대 최대 실적 및 수익성 개선을 동시에 달성.

• 2025.12.19: 신한투자증권, 2026년 미국 시장 진출 본격화로 성장이 가속화되고 하반기 흑자전환이 기대된다는 긍정적 리포트 발표.

• 2025.12.04: 제62회 무역의 날 기념식에서 '3백만불 수출의 탑'을 수상하며 꾸준한 해외 수출 실적을 인정받음.

• 2025.11.13: 2025년 3분기 실적 발표. 매출 32억 원으로 7분기 연속 성장 및 영업손실 감소.

• 2025.10.23: 미국 텍사스에 현지 법인 '3billion US, Inc.' 설립을 결의하며 미국 시장 진출을 공식화.

• 2025.08.14: 2025년 상반기 실적 발표. 매출 46억 원으로 전년 동기 대비 107% 성장.

• 2025.04.12: AI 기반 유전변이 해석 소프트웨어 '제브라(GEBRA™)'를 SaaS 형태로 출시, 사업 포트폴리오 다각화.

• 2024.11.14: 한국투자증권을 주관사로 코스닥 시장에 상장.